台大調查郭明良案進度牛步，且讓郭繼續在職並領取獎補助，引發輿論爭議。對此，曾在升等時受到校方刁難與不合理對待，憤而提告並絕食抗議，國立東華大學教授諮商與臨床心理學系教授王純娟痛批楊「戀棧權位」，質疑被稱為「技轉王」的科技部長陳良基不吭聲，應追回陳良基領走的獎補助款項。
南華大學副教授周平則批評，台大案最嚴重的是造成社會對台大失去信任，台灣很多學者因為「板塊擠壓」的結構問題，從天使變成路西法（Lucifar），也造就「學閥」。且不只論文造假，評鑑也造假，教職員工生變成一種血汗勞動。他說，這已侵犯到「人權」，「教育部一定要管」。
